コンフレックス株式会社では、配座空間探索プログラムCONFLEXシリーズ およびグラフィカル・ユーザー・インタフェースを開発・販売し、 短時間で正確な分子配座解析を行うシステムを提供しております。

CONFLEXはフレキシブルな分子の配座空間を探索し、化学的に重要な配座異性体の最適化構造をもれなく見つけ出します。
今までの構造最適化プログラムでは、ユーザーが入力した初期構造に依存した局所的な最適化構造しか求めることができず、最安定構造さえも特定することが困難でした。 そのため、フレキシブルな分子の性質や挙動に関して、限られた情報しか得ることができませんでした。
CONFLEXはその問題を解決し、フレキシブルな多配座分子を解析することを可能にしました。そのアルゴリズムとなる原理は次のとおりです。

  • 初期構造の選択と探索領域の拡大
  • 局所的な微小変形(corner flap, edge flip, stepwise rotation)
  • 構造最適化と配座チェック

また、米国Gaussian社の販売代理店として、分子軌道法計算プログラム
GaussianおよびGaussViewの販売及びサポートを、 米国PerkinElmer社の販売代理店としてChemOffice&ChemDrawの販売を行っております。

また、GaussianおよびGaussViewの使い方の講習会も行っております。
さらに、生体高分子研究用の分子動力学計算プログラムAMBERの販売・サポートも行っております。

コンフレックス社ではこれらプロダクトのインストレーションやサポート、受託計算サービスなどの計算化学ソリューションをお客様のニーズに合わせて幅広く承っております。

CONFLEXを使用した配座探索利用例

  • Ab initio 計算(Gaussian)のためのプレ・オプティマイザー
  • X線、NMR構造解析の初期解析(立体構造の決定)
  • 反応解析、合成設計・戦略のための道具
  • 創薬のためのドッキング・シミュレーション
  • 薬物候補化合物の柔軟性と安定配座の同定
  • タンパク質フォールディング予測
CONFLEXバージョンアップ情報
CONFLEX 8 新機能 more info
  1. 動的反応座標計算(Dynamic Reaction Coordinate, DRC)の導入
  2. 配座探索時のGaussian呼び出し機能
  3. OpenMPによる結晶構造最適化の並列化
  4. 結晶構造探索のOpenMP/MPIハイブリッド並列化
  5. 配座の二面角によるチェックの高速化
  6. 計算に用いる元素質量の改定
Interface 8の新機能
  1. OpenGL SLへの対応による描画の高速化
  2. 振動モードのアニメーション表示
  3. 結晶面の表示(h,k,lによる指定)
  4. 分子のライン表示
  5. 結合していない原子間のラベル表示
  6. 複数のラベル表示を行うWatch List機能
  7. 結晶中の分子間ラベル
  8. 新規ツールバーの追加
  9. 新規計算手法への対応
  10. PDBファイルの読み込みの強化
今後の機能追加予定
  1. タンパク質-リガンド複合体の誘起的
    ドッキングのための動的最適化法
  2. 自由エネルギーの低波数補正
  3. タンパク質活性サイト内の配座探索法
  4. 簡易ホモロジーモデリング
  5. 液滴モデルによるMD法
  6. タンパク質上のリガンド結合部位の探索
製品概要
CONFLEX more info
フレキシブルな分子の配座空間を探索し、最安定構造および化学的に重要な配座異性体の最適化構造を高速にもれなく見つけ出します。

Gaussian more info
米国Gaussian社の販売代理店として、分子軌道法計算プログラムGaussianおよびGaussViewの販売およびサポートを行っております。

ChemDraw/Office more info
米国PerkinElmer Informaticsの販売代理店として
ChemDraw/Officeシリーズの販売を行っております。

Amber more info
米国UCSFの販売代理店として、生体高分子研究用分子動力学計算プログラムAMBERの販売およびサポートを行っております。

受託計算サービス more info
計算化学を利用したいが計算できる環境をお持ちでない大学、官庁、企業のお客様、 コンフレックス社の並列計算システム(グリッド環境)を応用した計算化学資源をご利用いただき、研究開発の時間短縮に計算化学をお役立て下さい。

計算化学サポートサービス more info
コンフレックス社では計算化学が初心者のお客様でも安心して利用できるように、経験豊富な計算化学専門スタッフによるサポートをご提供しております。


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