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周期境界条件（Periodic Boundary Conditions, PBC）
チュートリアル６：
ダイヤモンド結晶の面心立方格子の基本単位胞への変換
（３次元PBC）
6-1 まず、PBCチュートリアル４の4-1〜4-8までを行ってください。続いて、以下のようにします：
(a) 「PBC」ダイアログの「Symmetry」タブで、「Enable Space Group Symmetry」ボックスのチェックを外す
(b) 「PBC」ダイアログの「Cell」タブで、「Cell Changes」ドロップダウンリストから「Fix Contents' Cartesian Coordinates」を選択
6-2 「PBC」ダイアログの「Cell」タブで、「Place」ボタンを押してから「a (1,0,0)」を選択します。これにより、マウスを使用してセルの「a」格子ベクトルの先端を分子ビューウィンドウで指定できます。分子ビューウィンドウで、７番原子をクリックします。
6-3 「PBC」ダイアログの「Cell」タブで、「b (0,1,0)」を選択します。これにより、マウスを使用してセルの「b」格子ベクトルの先端を分子ビューウィンドウで指定できます。分子ビューウィンドウで、３番原子をクリックします。
6-4 「PBC」ダイアログの「Cell」タブで、「c (0,0,1)」を選択します。これにより、マウスを使用してセルの「c」格子ベクトルの先端を分子ビューウィンドウで指定できます。分子ビューウィンドウで、５番原子をクリックします。
6-5 「PBC」ダイアログの「Cell」タブで、「Trim Contents」ポップアップメニューから「Delete All Atoms Outside Cell」を選択します。
6-6 「PBC」ダイアログの「Contents」タブをクリックしてから、「Bonds」ポップアップメニューから「Rebond All」を選択します。
6-7 「PBC」ダイアログの「View」タブをクリックしてから、「Replicate Contents Display」ドロップダウンリストから「Dull」を選択します。
6-8 以上で、ダイヤモンド結晶の基本単位胞が作成できました。結晶構造は、最初の面心立方単位格子と同じになっています。
6-9 「PBC」ダイアログの「View」タブで、「Show All Boundary Atoms」ボックスのチェックを外します。
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