CONFLEX Spectra Analyzer

Spectra Analyzerは、CONFLEXで求めた各配座を入力として、CONFLEXあるいはGaussianでスペクトル計算した結果を解析するプログラムです。

以下のスペクトルに対応しています：

• CONFLEXの振動計算
• CONFLEXのUV/CD計算
• CONFLEXの結晶粉末X線回折パターン
• GaussianのFreqキーワードによる計算(VCDを含む)
• GaussianのUV/Vis計算を行ったfchkファイル

このプログラムでは、以下の操作が可能です:

• 複数のファイルからスペクトルをまとめて表示
• 結晶探索結果からの粉末X線回折パターンの重ね合わせ
• エネルギーから求めたBoltzmann分布に従った合成
• 合成するスペクトルの選択
• 表形式でのスペクトル情報の表示

起動

Spectra Analyzerは、CONFLEX InterfaceのApplicationsメニューから選択する事により、起動します。この時自動的に、CONFLEX Interface側で最前面になっていたファイルのパスがそのまま引き継がれます。その際、同じフォルダー内の関連ファイルが全て、自動的に開きます。
起動すると、上図に示したウィンドウが表示されます。図は、7配座分読み込まれ、各スペクトル及び合成スペクトルが表示された状態です。

機能の説明

Fileメニュー

結晶計算のPXRDデータを表示している時に「Open Experimental Data」を選択あるいはウィンドウの「Experimental Spectrum」にチェックを入れるとダイアログが開き、実験データを読み込んでチャート上に重ねて表示できます。

Viewメニュー

「View」メニューの「Spectra」から「IR」「Raman」「UV」「CD」あるいは「PXRD」を選択することにより、スペクトル表示の切り替えが可能です。また、ツールバーの「Spectra」プルダウンメニューからも選択できます。

メイン・ウィンドウ

メイン・ウィンドウの左側には、読み込んだファイルの情報が表示されます。各項目名の左側のチェックボックスをクリックすることにより、合成するスペクトルの構成を変更できます。
左下の「Select All」ボタンをクリックすると、全てのスペクトルが選択された状態になります。
「Reset Selection」ボタンをクリックすると、最初の項目のみ選択状態となります。
「Combined Plot」「Overlay Plot」はどちらも、CONFLEX Interfaceのスペクトル表示の操作と同様に、マウス操作により拡大・縮小表示することが可能です。詳しくは、マニュアルをご覧ください。

ツールバーの一番左のドロップダウンメニューを使用して、プログラムの動作モードを「Analyze」あるいは「Overlay」に切り替えられます。「Analyze」モードでは、スペクトルが合成されたグラフと、各スペクトルが個別に重ね合わされた状態のグラフが、上下に並べて表示されます。「Overlay」モードでは、読み込まれたスペクトルが重ね合わされた表示のみになります。

チャートカラー

Strength Line

ウィンドウ左上部にある「Strength Line」にチェックを入れると、スペクトルを構成している吸収位置と強度が、チャート内に線表示されます。

Update Population